分類總是五花八門，總體來說可以分為PCR擴增儀和實時熒光PCR儀兩大類，有人也把它們稱為半自動和全自動，或者定性和定量，都是比較不準確的稱呼。
PCR重要的就是個升降溫過程，初的水浴鍋式PCR，就是三個水浴箱，一個機械臂，定時抓出反應槽轉換水浴鍋。這種東東體積大，迅速慢，但其實結果并不比以后的PCR儀差，我現在都很欣賞。后來有人利用致冷和加熱做成了，固定位置升降溫的PCR擴增儀。
后來隨著定量技術的發展，有公司將擴增儀和檢測做成一體，也就成了現在所謂的全自動（或定量）PCR儀。當然標準的叫實時熒光定量PCR儀。
【品牌】
什么東西都有品牌，現在國內國外PCR儀的品牌很多，就國外而言比較的有：
ABI美國應用生物公司：老牌的生物公司貴族，其收購了原來的PE，而PE公司是PCR的*，旗下有很多經典的PCR儀，有5700（已停產）、7700（已停產）、7000、7900等實時熒光定量PCR儀。
ROCHE羅氏診斷：炙手可熱的新貴，LIGHTCYCLER是的PCR儀，市場做得很不錯，以科研定位為主，但在國內很多醫院使用，其很特色離心、氣加熱、毛細管等，設計另類，是有特色的PCR儀，當然好壞另議，就單其另辟蹊徑的技術能力和膽識就值的佩服。
MJ：剛入中國的名流，MJ的擴增儀在生命科研領域比較出名，其產品比較適合高通量檢測，人類基因組計劃用得很多。其實時熒光PCR儀剛進入中國不久，孔間能使用不同溫度是其特色。這點其實比較有用。
伯樂：呵，廉價的麥當勞，ICYCLER是其主打，進入中國已經比較久了，產品和5700一樣，是擴增儀上加裝定量模塊而成，特點是價格較低。
國內現在做的也很多，比如杭州博日、杭州朗基、上海楓嶺、廈門安普利等。
【選購】
準確的講包括實時熒光定量在內都沒有自動加樣和標本處理系統，只能算半自動的。PCR儀是個簡單的東東，一個溫控設備和一個檢測設備而已。
關于溫控，主要是介質問題。理想的介質是導熱性好、比熱大、接觸緊密的東東。
這方面的是水浴和油浴，比熱大（油比水更大）、溶劑化物體，與反應物無縫接觸，效果當然。但是自動化，小型化難，只有初的水浴鍋式使用。
硅加熱，這是使用普遍的一種，優點：易自動化、速度快、直接加熱降溫，效果當然好，但是成本較高，第二其使用的介質是金屬，導熱雖然好，但是與反應管，很難做到無縫接觸，定性時代可以加油，但用熒光定，由于油有熒光信號不能用。所以在無縫接觸上差一些。第三由于是底部加熱，下部壓力較大，有溢出的可能，不過新的儀器在加熱蓋以后解決了這個問題。
空氣加熱，用空氣做介質有優點，與反應體系無縫接觸，但是空氣的導熱性差、比熱小的弱點明顯。因此空氣加熱的要利用離心來產生空氣流動，增強導熱性，同時使用毛細管，加大接觸面積、試劑微量化來彌補。這樣做了以后效果還是不錯。但有的廠商把什么離心、毛細管的好處大講特講，對氣加熱的弱點閉口不談，卻是高明的市場手法。同時，使用離心，對標本量增大是有影響的并且標本量越大，空氣比熱小的弱點就越明顯，所以空所加熱的儀器標本量都比較小。使用毛細管后由于反應液與管的接觸面積增大，吸附現象更大，因此試劑的通用性差一般要專門開發，成本高，雖然試劑用量少，但因為是試劑，每人份就是以實際量算，并不省試劑。反而增加了毛細管成本。
關于功能，所有的PCR儀功能都大體相同。只有MJ孔間能使用不同溫度比較新穎，這對于多項目同時檢測以及循環參數的調整比較有用。但其實時熒光的儀器剛進入中國不久，具體如何還不得而知。
關于選購，根據單位情況而定，由于PCR的技術含量其實并不高，好的國產儀器如杭州博日（與日本廠商大和有關）也差不太多。關于進口儀器，羅氏的儀器不錯，但如果標本量大，建議不要用羅氏。一則會累死的。另外，每個標本要分攤的標準曲線、對照成本太高。同時，試劑也比較受限。
